Namkhai Yeshe nació en Italia en 1970, en la familia del maestro de Dzogchen Chögyal Namkhai Norbu (1938–2018). Recibió una educación tanto cristiana como budista, y también estudió cine, filosofía e informática. Su carrera profesional estuvo vinculada al sector de las tecnologías de la información en empresas medianas, donde ocupó cargos de creciente responsabilidad. Ya en su infancia,
Su Santidad Sakya Trizin lo reconoció como la reencarnación de su tío materno, Jamyang Khyentse Chökyi Wangchuk (1909–1960), y le dio el nombre de Jamyang Chökyi Nyima. En 2007, Namkhai Yeshe visitó el Tíbet y su monasterio. A petición de su padre, siempre se ha ocupado del futuro de la Comunidad Dzogchen, introduciendo métodos y tecnologías modernas que apoyan su evolución natural.
Hoy, como sostenedor de la transmisión y el linaje de Chögyal Namkhai Norbu, es el guía espiritual de la Comunidad Dzogchen Internacional y combina este papel con sus responsabilidades familiares, profesionales y sociales. Durante los últimos cinco años, Namkhai Yeshe ha estudiado música electrónica en el Conservatorio Luigi Cherubini de Florencia y hoy compone su propia música. Utiliza el sonido y el lenguaje de la música electroacústica para hacer más accesibles el conocimiento antiguo y la experiencia meditativa. Dirige retiros periódicos en los centros de la Comunidad Dzogchen.